自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算
Differences
This shows you the differences between two versions of the page.
| Both sides previous revision Previous revision Next revision | Previous revision Next revision Both sides next revision | ||
|
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/02 17:57] koudai [ノード間並列計算] |
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/02 18:11] koudai [概要] |
||
|---|---|---|---|
| Line 2: | Line 2: | ||
| * 実際にMPIを用いたノード内およびノード間の並列計算を行います | * 実際にMPIを用いたノード内およびノード間の並列計算を行います | ||
| - | * 事前にOpenMPIやMPICH2などのMPIライブラリを管理ノードにインストールしてください | + | * 事前にOpenMPI, MPICH2, Intel MPIなどのMPIライブラリを管理ノードにインストールしてください |
| * 例えばOpenMPIであれば次のようにインストールできます< | * 例えばOpenMPIであれば次のようにインストールできます< | ||
| $ sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev | $ sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev | ||
| </ | </ | ||
| + | * **同じコンピュータに複数のMPIを入れると競合を起こしてMPIが動かなくなることがあります** | ||
| ====== 準備 ====== | ====== 準備 ====== | ||
| Line 107: | Line 107: | ||
| $ mpiicc -o hello hello.c | $ mpiicc -o hello hello.c | ||
| </ | </ | ||
| - | * 管理ノード（4スレッド）で走らせてみます< | + | * 試しに管理ノードで走らせてみます< |
| $ mpirun -n 4 hello | $ mpirun -n 4 hello | ||
| Hello World! I am 0 of 4 from kanri. | Hello World! I am 0 of 4 from kanri. | ||
| Line 121: | Line 121: | ||
| 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。 | 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。 | ||
| - | * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション--hostでホスト名を指定します | + | * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション< |
| - | * 計算ノードkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします< | + | * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします< |
| $ mpirun -n 24 --host keisan11 hello | $ mpirun -n 24 --host keisan11 hello | ||
| Hello World! I am 0 of 24 from keisan11. | Hello World! I am 0 of 24 from keisan11. | ||
| Line 144: | Line 144: | ||
| Hello World! I am 3 of 4 from keisan12. | Hello World! I am 3 of 4 from keisan12. | ||
| </ | </ | ||
| - | * MPIがプロセス数に応じて各ノードにスレッドを割り振ります | + | * MPIが各ノードに均等にプロセスを割り振ります |
| + | * 並列計算におけるスレッド間の通信を考えたとき、ノード間の通信はノード内の通信に比べて非常に遅いです。できるだけ通信をしないようなプログラムが要求されます。 | ||
| ====== 参考 ====== | ====== 参考 ====== | ||
自作クラスタ計算機/mpiによる並列計算.txt · Last modified: 2023/12/26 23:43 by koudai
Page Tools
Except where otherwise noted, content on this wiki is licensed under the following license: CC Attribution-Share Alike 4.0 International
