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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算

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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/02 18:01]
koudai [サンプルプログラム]
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/02 18:30]
koudai [ノード間並列計算]
Line 2: Line 2:
  
   * 実際にMPIを用いたノード内およびノード間の並列計算を行います   * 実際にMPIを用いたノード内およびノード間の並列計算を行います
-  * 事前にOpenMPIMPICH2などのMPIライブラリを管理ノードにインストールしてください+  * 事前にOpenMPIMPICH2, Intel MPIなどのMPIライブラリを管理ノードにインストールしてください
   * 例えばOpenMPIであれば次のようにインストールできます<code>   * 例えばOpenMPIであれば次のようにインストールできます<code>
 $ sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev $ sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev
 </code> </code>
 +  * **同じコンピュータに複数のMPIを入れると競合を起こしてMPIが動かなくなることがあります**
  
 ====== 準備 ====== ====== 準備 ======
Line 137: Line 137:
  
   * オプション<nowiki>--host</nowiki>で複数のホスト名を指定します   * オプション<nowiki>--host</nowiki>で複数のホスト名を指定します
-  * 計算ノードkeisan11keisan12にジョブを投げる場合は次のようにします<code> +  * 計算ノードkeisan11keisan12, keisan13にジョブを投げる場合は次のようにします<code> 
-$ mpirun -n --host keisan11,keisan12 hello +$ mpirun -n 72 --host keisan11,keisan12,keisan13 hello 
-Hello World! I am 0 of from keisan11. +Hello World! I am 0 of 72 from keisan11. 
-Hello World! I am 1 of from keisan11+Hello World! I am 1 of 72 from keisan12
-Hello World! I am 2 of from keisan12+Hello World! I am 2 of 72 from keisan13
-Hello World! I am 3 of 4 from keisan12.+Hello World! I am 3 of 72 from keisan11. 
 +Hello World! I am of 72 from keisan12. 
 +Hello World! I am 5 of 72 from keisan13. 
 +(以下略)
 </code> </code>
-    * MPIがプロセス数に応じて各ノードにスレッドを割り振ります+    * MPIが各ノードにプロセスを割り振ります 
 +    * keisan11 -> keisan12 -> keisan13 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます
  
 ====== 参考 ====== ====== 参考 ======
自作クラスタ計算機/mpiによる並列計算.txt · Last modified: 2023/12/26 23:43 by koudai