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--- 自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/02 18:30]
koudai [ノード間並列計算]
+++ 自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/02 21:19]
koudai [概要]
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   * 実際にMPIを用いたノード内およびノード間の並列計算を行います
   * 事前にOpenMPI, MPICH2, Intel MPIなどのMPIライブラリを管理ノードにインストールしてください
-  * 例えばOpenMPIであれば次のようにインストールできます<code>
+  * OpenMPIの場合、次のようにaptで簡単にインストールできるので、特にこだわりがなければお勧めです<code>
 $ sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev
 </code>
-  * **同じコンピュータに複数のMPIを入れると競合を起こしてMPIが動かなくなることがあります**
+  * **複数のMPIを一つのコンピュータに入れると、競合を起こしてMPIが動かなくなります**
 ====== 準備 ======
@@ Line 133: / Line 133: @@
 ===== ノード間並列計算 =====
+==== 通常の使い方 ====
 複数の計算ノードにわたるジョブを投げてみます。
@@ Line 147: / Line 149: @@
 （以下略）
 </code>
-    * MPIが各ノードにプロセスを割り振ります
     * プロセスは keisan11 -> keisan12 -> keisan13 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます
+==== ホストファイルによるジョブの投入 ====
+例えば計算ノードによって性能に差がある場合など、ノードごとのプロセス数を自分で管理したい場合はホストファイルを作成します。
+  * MPICH, Intel MPIの場合
+<file - my_hosts>
+keisan11:2
+keisan12:3
+</file>
+  * OpenMPIの場合
+<file - my_hosts>
+keisan11 slots=2
+keisan12 slots=3
+</file>
+次のように実行します
+<code>
+$ mpirun -n 6 --hostfile my_hosts hello
+Hello World! I am 0 of 6 from keisan11.
+Hello World! I am 1 of 6 from keisan11.
+Hello World! I am 2 of 6 from keisan12.
+Hello World! I am 3 of 6 from keisan12.
+Hello World! I am 4 of 6 from keisan12.
+Hello World! I am 5 of 6 from keisan11.
+</code>
+    * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます
 ====== 参考 ======

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