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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/02 21:40] koudai [ホストファイルによるジョブの投入] |
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 15:43] koudai [ホストファイルによるジョブの投入] |
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---|---|---|---|
Line 96: | Line 96: | ||
name[len] = ' | name[len] = ' | ||
| | ||
- | printf( " | + | printf( " |
MPI_Finalize(); | MPI_Finalize(); | ||
Line 109: | Line 109: | ||
* 試しに管理ノードで走らせてみます< | * 試しに管理ノードで走らせてみます< | ||
$ mpirun -n 4 ./hello | $ mpirun -n 4 ./hello | ||
- | Hello World! I am 0 of 4 from kanri. | + | Hello world: rank 0 of 4 running on kanri |
- | Hello World! I am 1 of 4 from kanri. | + | Hello world: rank 1 of 4 running on kanri |
- | Hello World! I am 2 of 4 from kanri. | + | Hello world: rank 2 of 4 running on kanri |
- | Hello World! I am 3 of 4 from kanri. | + | Hello world: rank 3 of 4 running on kanri |
</ | </ | ||
Line 121: | Line 121: | ||
指定した計算ノードにジョブを投げてみます。 | 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。 | ||
- | * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション< | + | * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション< |
* 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします< | * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします< | ||
- | $ mpirun -n 24 --host keisan11 ./hello | + | $ mpirun -n 8 -hosts keisan11 ./hello |
- | Hello World! I am 0 of 24 from keisan11. | + | Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 1 of 24 from keisan11. | + | Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 2 of 24 from keisan11. | + | Hello world: rank 2 of 8 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 3 of 24 from keisan11. | + | Hello world: rank 3 of 8 running on keisan11 |
- | (以下略) | + | Hello world: rank 4 of 8 running on keisan11 |
+ | Hello world: rank 5 of 8 running on keisan11 | ||
+ | Hello world: rank 6 of 8 running on keisan11 | ||
+ | Hello world: rank 7 of 8 running on keisan11 | ||
</ | </ | ||
Line 138: | Line 141: | ||
複数の計算ノードにわたるジョブを投げてみます。 | 複数の計算ノードにわたるジョブを投げてみます。 | ||
- | * オプション< | + | * オプション< |
* 計算ノードkeisan11, | * 計算ノードkeisan11, | ||
- | $ mpirun -n 72 --host keisan11, | + | $ mpirun -n 10 -hosts keisan11, |
- | Hello World! I am 0 of 72 from keisan11. | + | Hello world: rank 0 of 10 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 1 of 72 from keisan12. | + | Hello world: rank 1 of 10 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 2 of 72 from keisan13. | + | Hello world: rank 2 of 10 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 3 of 72 from keisan11. | + | Hello world: rank 3 of 10 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 4 of 72 from keisan12. | + | Hello world: rank 4 of 10 running on keisan12 |
- | Hello World! I am 5 of 72 from keisan13. | + | Hello world: rank 5 of 10 running on keisan12 |
- | (以下略) | + | Hello world: rank 6 of 10 running on keisan12 |
+ | Hello world: rank 7 of 10 running on keisan12 | ||
+ | Hello world: rank 8 of 10 running on keisan13 | ||
+ | Hello world: rank 9 of 10 running on keisan13 | ||
</ | </ | ||
- | | + | |
==== ホストファイルによるジョブの投入 ==== | ==== ホストファイルによるジョブの投入 ==== | ||
Line 159: | Line 164: | ||
<file - my_hosts> | <file - my_hosts> | ||
keisan11:2 | keisan11:2 | ||
- | keisan12:3 | + | keisan12:4 |
</ | </ | ||
* OpenMPIの場合 | * OpenMPIの場合 | ||
<file - my_hosts> | <file - my_hosts> | ||
keisan11 slots=2 | keisan11 slots=2 | ||
- | keisan12 slots=3 | + | keisan12 slots=4 |
</ | </ | ||
次のように実行します | 次のように実行します | ||
< | < | ||
- | $ mpirun -n 6 --hostfile | + | $ mpirun -n 6 -f my_hosts ./hello |
- | Hello World! I am 0 of 6 from keisan11. | + | Hello world: rank 0 of 6 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 1 of 6 from keisan11. | + | Hello world: rank 1 of 6 running on keisan11 |
- | Hello World! I am 2 of 6 from keisan12. | + | Hello world: rank 2 of 6 running on keisan12 |
- | Hello World! I am 3 of 6 from keisan12. | + | Hello world: rank 3 of 6 running on keisan12 |
- | Hello World! I am 4 of 6 from keisan12. | + | Hello world: rank 4 of 6 running on keisan12 |
- | Hello World! I am 5 of 6 from keisan11. | + | Hello world: rank 5 of 6 running on keisan12 |
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- | * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます | + | * プロセスは keisan11 -> keisan11 |
+ | * Intel MPIの場合は< | ||
+ | * https:// | ||
====== 参考 ====== | ====== 参考 ====== |