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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算

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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 15:22]
koudai
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 15:37]
koudai [通常の使い方]
Line 96: Line 96:
     name[len] = '\0';     name[len] = '\0';
          
-    printf( "Hello World! I am %d of %d from %s.\n", rank, size, name );+    printf( "Hello world: rank %d of %d running on %s\n", rank, size, name );
  
     MPI_Finalize();     MPI_Finalize();
Line 109: Line 109:
   * 試しに管理ノードで走らせてみます<code>   * 試しに管理ノードで走らせてみます<code>
 $ mpirun -n 4 ./hello $ mpirun -n 4 ./hello
-Hello World! I am 0 of 4 from kanri. +Hello world: rank 0 of 4 running on kanri 
-Hello World! I am 1 of 4 from kanri. +Hello world: rank 1 of 4 running on kanri 
-Hello World! I am 2 of 4 from kanri. +Hello world: rank 2 of 4 running on kanri 
-Hello World! I am 3 of 4 from kanri.+Hello world: rank 3 of 4 running on kanri
 </code> </code>
  
Line 121: Line 121:
 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。
  
-  * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション<nowiki>--host</nowiki>でホスト名を指定します+  * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション<nowiki>-hosts</nowiki>でホスト名を指定します
   * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします<code>   * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします<code>
-$ mpirun -n 24 --host keisan11 ./hello +$ mpirun -n -hosts keisan11 ./hello 
-Hello World! I am 0 of 24 from keisan11. +Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 
-Hello World! I am 1 of 24 from keisan11. +Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 
-Hello World! I am 2 of 24 from keisan11. +Hello world: rank 2 of 8 running on keisan11 
-Hello World! I am 3 of 24 from keisan11. +Hello world: rank 3 of 8 running on keisan11 
-(以下略)+Hello world: rank 4 of 8 running on keisan11 
 +Hello world: rank 5 of 8 running on keisan11 
 +Hello world: rank 6 of 8 running on keisan11 
 +Hello world: rank 7 of 8 running on keisan11
 </code> </code>
  
Line 140: Line 143:
   * オプション<nowiki>-hosts</nowiki>で複数のホスト名を指定します   * オプション<nowiki>-hosts</nowiki>で複数のホスト名を指定します
   * 計算ノードkeisan11, keisan12, keisan13にジョブを投げる場合は次のようにします<code>   * 計算ノードkeisan11, keisan12, keisan13にジョブを投げる場合は次のようにします<code>
-$ mpirun -n 72 -hosts keisan11,keisan12,keisan13 ./hello +$ mpirun -n 10 -hosts keisan11,keisan12,keisan13 ./hello 
-Hello World! I am 0 of 72 from keisan11. +Hello world: rank 0 of 10 running on keisan11 
-Hello World! I am 1 of 72 from keisan12. +Hello world: rank 1 of 10 running on keisan11 
-Hello World! I am 2 of 72 from keisan13. +Hello world: rank 2 of 10 running on keisan11 
-Hello World! I am 3 of 72 from keisan11. +Hello world: rank 3 of 10 running on keisan11 
-Hello World! I am 4 of 72 from keisan12. +Hello world: rank 4 of 10 running on keisan12 
-Hello World! I am 5 of 72 from keisan13. +Hello world: rank 5 of 10 running on keisan12 
-(以下略)+Hello world: rank 6 of 10 running on keisan12 
 +Hello world: rank 7 of 10 running on keisan12 
 +Hello world: rank 8 of 10 running on keisan13 
 +Hello world: rank 9 of 10 running on keisan13
 </code> </code>
 +  * どうやら管理ノードのプロセス数だけ投げたら次のノードに行く、という仕組みみたいです。(未確認)
  
 ==== ホストファイルによるジョブの投入 ==== ==== ホストファイルによるジョブの投入 ====
Line 168: Line 175:
 <code> <code>
 $ mpirun -n 6 -f my_hosts ./hello $ mpirun -n 6 -f my_hosts ./hello
-Hello World! I am 0 of 6 from keisan11.+Hello World; rank 0 of 6 running on keisan11.
 Hello World! I am 1 of 6 from keisan11. Hello World! I am 1 of 6 from keisan11.
 Hello World! I am 2 of 6 from keisan12. Hello World! I am 2 of 6 from keisan12.
Line 177: Line 184:
     * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます     * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます
     * Intel MPIの場合は<nowiki>-f</nowiki>の代わりに<nowiki>-machinefile</nowiki>あるいは<nowiki>-machine</nowiki>を使用してください     * Intel MPIの場合は<nowiki>-f</nowiki>の代わりに<nowiki>-machinefile</nowiki>あるいは<nowiki>-machine</nowiki>を使用してください
 +      * https://software.intel.com/en-us/articles/controlling-process-placement-with-the-intel-mpi-library 
  
 ====== 参考 ====== ====== 参考 ======
自作クラスタ計算機/mpiによる並列計算.txt · Last modified: 2023/12/26 23:43 by koudai