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--- 自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 15:35]
koudai [通常の使い方]
+++ 自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 16:03]
koudai [通常の使い方]
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 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。
-  * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション<nowiki>-host</nowiki>でホスト名を指定します
+  * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション<nowiki>-hosts</nowiki>でホスト名を指定します
   * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします<code>
-$ mpirun -n 8 -host keisan11 ./hello
+$ mpirun -n 8 -hosts keisan11 ./hello
 Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11
 Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11
@@ Line 143: / Line 143: @@
   * オプション<nowiki>-hosts</nowiki>で複数のホスト名を指定します
   * 計算ノードkeisan11, keisan12, keisan13にジョブを投げる場合は次のようにします<code>
-$ mpirun -n 10 -hosts keisan11,keisan12,keisan13 ./hello
+$ mpirun -hosts keisan11,keisan12,keisan13 -n 8 -ppn 2 ./hello
 Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11
 Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11
-Hello world: rank 2 of 8 running on keisan11
+Hello world: rank 2 of 8 running on keisan12
-Hello world: rank 3 of 8 running on keisan11
+Hello world: rank 3 of 8 running on keisan12
-Hello world: rank 4 of 8 running on keisan11
+Hello world: rank 4 of 8 running on keisan13
-Hello world: rank 5 of 8 running on keisan11
+Hello world: rank 5 of 8 running on keisan13
 Hello world: rank 6 of 8 running on keisan11
 Hello world: rank 7 of 8 running on keisan11
 </code>
-  * どうやら管理ノードのプロセス数だけ投げたら次のノードに行く、という仕組みみたいです。（未確認）
+  * オプション-ppnでノードあたりのスレッド数を指定します
+  * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan13 -> keisan13 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> ... の順に割り振られていきます
 ==== ホストファイルによるジョブの投入 ====
-例えば計算ノードによって性能に差がある場合など、ノードごとのプロセス数を自分で管理したい場合はホストファイルを作成します。
+例えば計算ノードによってコア数が異なる場合など、ノードごとのプロセス数を自分で管理したい場合はホストファイルを作成します。
   * MPICH, Intel MPIの場合
 <file - my_hosts>
 keisan11:2
-keisan12:3
+keisan12:4
 </file>
   * OpenMPIの場合
 <file - my_hosts>
 keisan11 slots=2
-keisan12 slots=3
+keisan12 slots=4
 </file>
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 <code>
 $ mpirun -n 6 -f my_hosts ./hello
-Hello World; rank 0 of 6 running on keisan11.
+Hello world: rank 0 of 6 running on keisan11
-Hello World! I am 1 of 6 from keisan11.
+Hello world: rank 1 of 6 running on keisan11
-Hello World! I am 2 of 6 from keisan12.
+Hello world: rank 2 of 6 running on keisan12
-Hello World! I am 3 of 6 from keisan12.
+Hello world: rank 3 of 6 running on keisan12
-Hello World! I am 4 of 6 from keisan12.
+Hello world: rank 4 of 6 running on keisan12
-Hello World! I am 5 of 6 from keisan11.
+Hello world: rank 5 of 6 running on keisan12
 </code>
-    * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます
+    * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます
     * Intel MPIの場合は<nowiki>-f</nowiki>の代わりに<nowiki>-machinefile</nowiki>あるいは<nowiki>-machine</nowiki>を使用してください
       * https://software.intel.com/en-us/articles/controlling-process-placement-with-the-intel-mpi-library

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