自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算
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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 16:35] koudai [概要] |
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 16:40] koudai [SSHの導入] |
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| Line 31: | Line 31: | ||
| * そこでパスフレーズなしのSSH鍵を作成することで、パスワードの入力を回避します | * そこでパスフレーズなしのSSH鍵を作成することで、パスワードの入力を回避します | ||
| - | - 管理ノードのジョブを投げるユーザーのアカウント（以下ではsugimotoとします）にログインし、SSH鍵を作成します。パスフレーズを聞かれるところでは、**なにも入力せずに**エンターを押します< | + | - 管理ノードのジョブを投げるユーザーのアカウント（以下ではsugimotoとします）にログインし、SSH鍵を作成します。パスフレーズを聞かれるところでは**なにも入力せずに**エンターを押します< |
| $ ssh-keygen -t rsa | $ ssh-keygen -t rsa | ||
| Generating public/ | Generating public/ | ||
| Line 123: | Line 123: | ||
| * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション< | * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション< | ||
| * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします< | * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします< | ||
| - | $ mpirun | + | $ mpirun -hosts keisan11 |
| Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 | Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 | ||
| Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 | Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 | ||
| Line 161: | Line 161: | ||
| ホスト名を毎回入力したくない、計算ノードによってプロセス数を変えたいなどの場合は、ホストファイルを作成します。 | ホスト名を毎回入力したくない、計算ノードによってプロセス数を変えたいなどの場合は、ホストファイルを作成します。 | ||
| - | * MPICH, Intel MPIの場合 | ||
| - | <file - my_hosts> | ||
| - | keisan11:2 | ||
| - | keisan12:4 | ||
| - | </ | ||
| * OpenMPIの場合 | * OpenMPIの場合 | ||
| <file - my_hosts> | <file - my_hosts> | ||
| keisan11 slots=2 | keisan11 slots=2 | ||
| keisan12 slots=4 | keisan12 slots=4 | ||
| + | </ | ||
| + | * MPICH, Intel MPIの場合 | ||
| + | <file - my_hosts> | ||
| + | keisan11:2 | ||
| + | keisan12:4 | ||
| </ | </ | ||
自作クラスタ計算機/mpiによる並列計算.txt · Last modified: 2023/12/26 23:43 by koudai
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