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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 16:40] koudai [SSHの導入] |
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/06 20:32] koudai [サンプルプログラム] |
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Line 74: | Line 74: | ||
作業は全て管理ノードで行います | 作業は全て管理ノードで行います | ||
- | * 生成したプログラムは管理ノードのNFSサーバの機能により全ノードに配布されます | + | * mpirunを実行するノード(管理ノード)とプログラムを動かすノード(計算ノード)が異なる場合は、mpirunを実行したノードと同じ名前のディレクトリに移動してプログラムを動かす仕組みになっています |
+ | * 今回生成したクラスタマシンでは、NFSサーバの機能により、管理ノードにあるプログラムが全ノードに配布されます | ||
Line 81: | Line 83: | ||
次のコードを使って説明します | 次のコードを使って説明します | ||
- | < | + | < |
#include < | #include < | ||
#include " | #include " | ||
Line 142: | Line 144: | ||
複数の計算ノードにわたるジョブを投げてみます。 | 複数の計算ノードにわたるジョブを投げてみます。 | ||
- | * オプション< | ||
* 計算ノードkeisan11, | * 計算ノードkeisan11, | ||
$ mpirun -hosts keisan11, | $ mpirun -hosts keisan11, | ||
Line 162: | Line 163: | ||
* OpenMPIの場合 | * OpenMPIの場合 | ||
- | <file - my_hosts> | + | <file - hosts.txt> |
keisan11 slots=2 | keisan11 slots=2 | ||
keisan12 slots=4 | keisan12 slots=4 | ||
</ | </ | ||
* MPICH, Intel MPIの場合 | * MPICH, Intel MPIの場合 | ||
- | <file - my_hosts> | + | <file - hosts.txt> |
keisan11:2 | keisan11:2 | ||
keisan12:4 | keisan12:4 | ||
Line 174: | Line 175: | ||
次のように実行します | 次のように実行します | ||
< | < | ||
- | $ mpirun -n 6 -f my_hosts | + | $ mpirun -n 6 -f hosts.txt |
Hello world: rank 0 of 6 running on keisan11 | Hello world: rank 0 of 6 running on keisan11 | ||
Hello world: rank 1 of 6 running on keisan11 | Hello world: rank 1 of 6 running on keisan11 |