This shows you the differences between two versions of the page.
Both sides previous revision Previous revision Next revision | Previous revision Next revision Both sides next revision | ||
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 16:48] koudai [ホストファイルによるジョブの投入] |
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 17:06] koudai [ホストファイルによるジョブの投入] |
||
---|---|---|---|
Line 74: | Line 74: | ||
作業は全て管理ノードで行います | 作業は全て管理ノードで行います | ||
- | * 生成したプログラムは管理ノードのNFSサーバの機能により全ノードに配布されます | + | * mpirunを実行するノード(管理ノード)とプログラムを動かすノード(計算ノード)が異なる場合は、mpirunを実行したノードと同じ名前のディレクトリに移動してプログラムを動かす仕組みになっています |
+ | * 今回生成したクラスタマシンでは、NFSサーバの機能により、管理ノードにあるプログラムが全ノードに配布されます | ||
Line 121: | Line 123: | ||
指定した計算ノードにジョブを投げてみます。 | 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。 | ||
- | * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション< | + | * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション< |
* 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします< | * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします< | ||
- | $ mpirun -host keisan11 -n 8 ./hello | + | $ mpirun -hosts keisan11 -n 8 ./hello |
Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 | Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 | ||
Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 | Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 | ||
Line 143: | Line 145: | ||
* 計算ノードkeisan11, | * 計算ノードkeisan11, | ||
- | $ mpirun -host keisan11, | + | $ mpirun -hosts keisan11, |
Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 | Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 | ||
Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 | Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 | ||
Line 182: | Line 184: | ||
</ | </ | ||
* プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます | * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます | ||
- | * Intel MPIの場合は< | + | * Intel MPIの場合は< |
* https:// | * https:// | ||