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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算

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自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/03 17:03]
koudai [並列計算]
自作クラスタ計算機:mpiによる並列計算 [2020/03/08 17:41]
koudai [概要]
Line 6: Line 6:
 $ sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev $ sudo apt install openmpi-bin libopenmpi-dev
 </code> </code>
 +    * aptで導入する場合は、すべてのノードでパッケージのインストールを行ってください
   * **複数のMPIを一つのコンピュータに入れると、競合を起こしてMPIが動かなくなります**   * **複数のMPIを一つのコンピュータに入れると、競合を起こしてMPIが動かなくなります**
  
Line 83: Line 84:
 次のコードを使って説明します 次のコードを使って説明します
  
-<file hello.c>+<file hello.c>
 #include <stdio.h> #include <stdio.h>
 #include "mpi.h" #include "mpi.h"
Line 123: Line 124:
 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。 指定した計算ノードにジョブを投げてみます。
  
-  * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション<nowiki>-host</nowiki>でホスト名を指定します+  * MPIで指定のホストに投げる場合は、オプション<nowiki>-hosts</nowiki>でホスト名を指定します
   * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします<code>   * 計算ノードのkeisan11にジョブを投げる場合は次のようにします<code>
-$ mpirun -host keisan11 -n 8 ./hello+$ mpirun -hosts keisan11 -n 8 ./hello
 Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11
 Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11
Line 145: Line 146:
  
   * 計算ノードkeisan11, keisan12, keisan13にジョブを投げる場合は次のようにします<code>   * 計算ノードkeisan11, keisan12, keisan13にジョブを投げる場合は次のようにします<code>
-$ mpirun -host keisan11,keisan12,keisan13 -n 8 -ppn 2 ./hello+$ mpirun -hosts keisan11,keisan12,keisan13 -n 8 -ppn 2 ./hello
 Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11 Hello world: rank 0 of 8 running on keisan11
 Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11 Hello world: rank 1 of 8 running on keisan11
Line 184: Line 185:
 </code> </code>
     * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます     * プロセスは keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> keisan11 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan12 -> keisan11 -> ... の順に割り振られて行きます
-    * Intel MPIの場合は<nowiki>-f</nowiki>の代わりに<nowiki>-machine</nowiki>を使用してください+    * Intel MPIの場合は<nowiki>-f</nowiki>の代わりに<nowiki>-machinefile</nowiki>を使用してください
       * https://software.intel.com/en-us/articles/controlling-process-placement-with-the-intel-mpi-library        * https://software.intel.com/en-us/articles/controlling-process-placement-with-the-intel-mpi-library 
  
自作クラスタ計算機/mpiによる並列計算.txt · Last modified: 2023/12/26 23:43 by koudai