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--- quantumespresso:フォノンの状態密度と分散 [2019/01/07 19:51]
koudai [電子状態計算]
+++ quantumespresso:フォノンの状態密度と分散 [2020/11/19 02:48]
koudai [固有振動モードの可視化]
@@ Line 9: / Line 9: @@
 <file - Si.scf.in>
 &control
-  calculation='scf',
+  calculation = 'scf',
-  prefix='Si'
+  prefix      = 'Si'
-  pseudo_dir = './pseudo',
+  pseudo_dir  = './pseudo',
-  outdir='./tmp/'
+  outdir      = './tmp/'
 /
 &system
@@ Line 22: / Line 22: @@
 /
 &electrons
-  conv_thr         = 1.0d-12
+  conv_thr = 1.0d-12
 /
 ATOMIC_SPECIES
@@ Line 40: / Line 40: @@
 <file - Si.ph.in>
 phonons of Si
- &inputph
+&inputph
-  tr2_ph=1.0d-14,
+  tr2_ph = 1.0d-14,
-  prefix='Si',
+  prefix = 'Si',
-  amass(1)=28.08,
+  outdir = './tmp/',
-  outdir='./tmp/',
+  fildyn = 'Si.dyn',
-  fildyn='Si.dyn',
+  ldisp  = .true.,
-  ldisp=.true.,
+  nq1    = 4,
-  nq1=4,
+  nq2    = 4,
-  nq2=4,
+  nq3    = 4,
-  nq3=4,
+/
- /
 </file>
@@ Line 59: / Line 58: @@
 実行は次のようにする。
-  $ ph.x < si.ph.in > si.ph.out
+  $ ph.x < Si.ph.in > Si.ph.out
-フォノンの計算には時間がかかるので注意。
+フォノンの計算には時間がかかるので、メッシュのとりすぎに注意。
 ===== 実空間へのフーリエ変換 =====
@@ Line 68: / Line 67: @@
 次のファイルを用意する。
-<file - q2r.in>
+<file - Si.q2r.in>
 &input
   fildyn = 'Si.dyn'
@@ Line 78: / Line 77: @@
 出力先はSi.fcになる。 実行は次のようにする。
-  $ q2r.x < q2r.in > q2r.out
+  $ q2r.x < Si.q2r.in > Si.q2r.out
 以上で準備は終了である。
@@ Line 89: / Line 88: @@
 次の入力ファイルを用意する。
-<file - matdyn.phdos.in>
+<file - Si.matdyn.phdos.in>
 &input
-  flfrc = 'si.fc'
+  flfrc = 'Si.fc'
-  fldos = 'si.phdos'
+  fldos = 'Si.phdos'
   asr = 'crystal'
   dos = .true.
@@ Line 112: / Line 111: @@
 実行は次のようにする。
-  $ matdyn.x < matdyn.phdos.in > matdyn.phdos.out
+  $ matdyn.x < Si.matdyn.phdos.in > Si.matdyn.phdos.out
+下図は Si.phdos に出力されたデータをプロットした。
 {{:quantumespresso:phdos.png?400|}}
@@ Line 119: / Line 120: @@
 ===== 分散 =====
-分散の場合は計算する波数点の経路を指定する。
+分散の場合は計算する波数点の経路（デカルト座標で、単位は格子定数aを使って2π/a）を指定する。
-<file - matdyn.freq.in>
+<file - Si.matdyn.freq.in>
 &input
   asr = 'crystal'
-  flfrc = 'si.fc'
+  flfrc = 'Si.fc'
-  flfrq = 'si.freq'
+  flfrq = 'Si.freq'
   q_in_band_form=.true.
 /
@@ Line 140: / Line 141: @@
 実行はさきほどと同様。
-  $ matdyn.x < matdyn.freq.in > matdyn.freq.out
+  $ matdyn.x < Si.matdyn.freq.in > Si.matdyn.freq.out
 結果はSi.freqに出力される。
@@ Line 146: / Line 147: @@
   $ plotband.x
-  Input file > si.freq
+  Input file > Si.freq
   Reading 6 bands at 41 k-points
   Range: 0.0000 510.2482eV Emin, Emax > 0, 550
@@ Line 163: / Line 164: @@
 {{:quantumespresso:ph_dispersion.png?400|}}
+  * GNUPLOTでプロットしたい場合は Si.freq.gp に出力されているものを使うと便利です。
+==== 固有振動モードの可視化 ====
+  * [[https://www.materialscloud.org/work/tools/interactivephonon|Interactive phonon visualizer]]を使えば、フォノンの各エネルギーに対応する固有振動モードを可視化することができます。
+  * Si.scf.in と matdyn.modes をアップロードしてください。
 ===== 注意 =====

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