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--- quantumespresso:フォノンの状態密度と分散 [2020/11/19 02:48]
koudai [固有振動モードの可視化]
+++ quantumespresso:フォノンの状態密度と分散 [2020/11/20 01:19]
koudai [固有振動モードの可視化]
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 ==== 固有振動モードの可視化 ====
-  * [[https://www.materialscloud.org/work/tools/interactivephonon|Interactive phonon visualizer]]を使えば、フォノンの各エネルギーに対応する固有振動モードを可視化することができます。
+  * [[http://henriquemiranda.github.io/phononwebsite/|Phonon website]]を使えば、フォノンの各エネルギーに対応する固有振動モードを可視化することができます。
-  * Si.scf.in と matdyn.modes をアップロードしてください。
+ホームディレクトリに戻り、Githubから必要なソフトをダウンロードします
+<code>
+$ cd
+$ git clone https://github.com/henriquemiranda/phononwebsite
+</code>
+インストールします
+<code>
+$ cd phononwebsite-gh-pages
+$ python setup.py install --user
+</code>
+フォノン計算の作業ディレクトリに入り、SCF計算の入力ファイルをprefix.scf、フォノン分散の計算で得られたmatdyn.modesをprefix.modesという名前にコピーします。
+prefixの部分はなんでも良いです。
+   * 結晶の基本並進ベクトル CELL_PARAMETERS を指定している場合は、ボーア半径で指定してください。
+   * 原子位置 (ATOMIC_POSITIONS) は分率座標 (crystal) で指定してください。
+そして次のコマンドを実行します。
+<code>
+$ read_qe_phonon.py prefix
+</code>
+すると prefix.json というファイルが得られます。
+さきほどダウンロードしたディレクトリの中にある phononwebsite-gh-pages/phonon.html か、あるいは https://henriquemiranda.github.io/phononwebsite/phonon.html を開き、Custom file の [Browse] で prefix.json を開きます。
+  * エネルギー分散をクリックすることで、そのエネルギーに対応する固有振動モードのアニメーションを見ることができます
+  * 振動のアニメーションを保存したい場合は Export movie の [gif] をクリックすると録画が開始します。
 ===== 注意 =====

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