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torque:インストール [2017/08/31 19:23] koudai |
torque:インストール [2017/09/01 16:22] koudai |
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- | ====== 準備 ====== | + | ====== |
以下のものを用意します。 | 以下のものを用意します。 | ||
Line 6: | Line 6: | ||
* 計算ノードサーバー × 必要な台数 ・・・ ヘッドノードからプログラムを受け取り、実際の計算を行う | * 計算ノードサーバー × 必要な台数 ・・・ ヘッドノードからプログラムを受け取り、実際の計算を行う | ||
- | ヘッドノードと計算ノードは兼用することも可能です。 | + | ヘッドノードはジョブを実行しないので、安価なパソコンで十分です(ただし、LANのポートが計算ノードにつなぐ用とインターネットにつなぐ用の2ヶ所が必要です)。 |
- | ヘッドノードからネットワーク・ハブを使って各計算ノードに接続します。 | + | 計算ノードは通常複数台ありますので、ネットワーク・ハブを使って各計算ノードとヘッドノードを接続します。 |
+ | |||
+ | ヘッドノードと計算ノードは兼用することも可能です。 | ||
====== ソフトのインストール ====== | ====== ソフトのインストール ====== | ||
+ | |||
+ | ヘッドノードおよび計算ノードにOSをインストールします。 | ||
+ | これらのノードのOSは揃えておきましょう。 | ||
+ | 以下ではUbuntu16.04を使うとします。 | ||
+ | |||
+ | OSが入ったら、GCCやIntel compilerなどのコンパイラをヘッドノードにインストールします。 | ||
+ | |||
+ | |||
+ | ====== Torqueのインストール ====== | ||
+ | |||
+ | 以下では、ヘッドノード1台と計算ノード2台を例に説明します。 | ||
+ | 各ノードのホスト名は | ||
+ | |||
+ | * keisan_head | ||
+ | * keisan01 | ||
+ | * keisan02 | ||
+ | |||
+ | とします。 | ||
+ | |||
+ | ちなみにホスト名は | ||
+ | |||
+ | >$ hostname | ||
+ | |||
+ | で確認することができます。 | ||
+ | / | ||
+ | >$ sudo vi / | ||
+ | <file - hosts> | ||
+ | 127.0.0.1 localhost | ||
+ | 127.0.0.1 keisan_head | ||
+ | |||
+ | # The following lines are desirable for IPv6 capable hosts | ||
+ | ::1 | ||
+ | fe00::0 ip6-localnet | ||
+ | ff00::0 ip6-mcastprefix | ||
+ | ff02::1 ip6-allnodes | ||
+ | ff02::2 ip6-allrouters | ||
+ | </ | ||
+ | もしファイルを変更したなら、コンピュータを再起動します。 | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | ===== ヘッドノード ===== | ||
+ | |||
+ | ヘッドノード用のTorqueを入れます。 | ||
>$ sudo apt install torque-server | >$ sudo apt install torque-server | ||
+ | |||
+ | |||
+ | ===== 計算ノード ===== | ||
+ | |||
+ | 計算ノード用のTorqueを入れます。 | ||
+ | |||
+ | >$ sudo apt install torque-mom torque-client | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | ====== Torqueの設定 ====== | ||
+ | |||
+ | ヘッドノードおよび計算ノードの両方で、/ | ||
+ | >$ sudo vi / | ||
+ | <file - server_name> | ||
+ | head | ||
+ | </ | ||
+ | 計算ノード側で設定することはこれ以上ありません。 | ||
+ | |||
+ | 次に、ヘッドノードの/ | ||
+ | >$ sudo vi / | ||
+ | <file - nodes> | ||
+ | keisan01 np=32 | ||
+ | keisan02 np=32 | ||
+ | </ | ||
+ | npで一度に実行できるジョブの最大数を指定します。 | ||
+ | 計算ノードで | ||
+ | $> cpuinfo | ||
+ | とすれば、各計算ノードで実行できるジョブの最大数(Processors(CPUs)の後ろにある数字)を確認できます。 | ||
+ | |||
+ | また、ヘッドノードの同じディレクトリにarraysというディレクトリがもしなければ作成します。 | ||
+ | >$ sudo mkdir / | ||
+ | |||
+ | 次に、実行権限を編集します。 | ||
+ | >\$ chmod 777 / | ||
+ | >\$ chmod o+t / | ||
+ | |||
+ | 以上が終われば、ジョブサーバーのpbs_serverを起動します。 | ||
+ | |||
+ | >$ sudo pbs_server -t create | ||
+ |