wien2k:インストール_19.1
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wien2k:インストール_19.1 [2019/07/11 18:09] koudai 作成 |
wien2k:インストール_19.1 [2021/04/03 03:54] koudai [準備] |
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|---|---|---|---|
| Line 1: | Line 1: | ||
| - | ====== | + | ====== |
| 以下のソフトを事前にインストールしてください。 | 以下のソフトを事前にインストールしてください。 | ||
| Line 5: | Line 5: | ||
| * tcsh | * tcsh | ||
| * XCrySDen | * XCrySDen | ||
| - | * FFTW3（MPI版） | + | * MPIでコンパイルしたFFTW3 ... < |
| - | * Libxc | + | |
| * C/ | * C/ | ||
| Line 20: | Line 19: | ||
| 商用だと50万円くらいしますが、アカデミック版は5万円くらいで買えます。 | 商用だと50万円くらいしますが、アカデミック版は5万円くらいで買えます。 | ||
| - | ===== コンパイル（Ubuntu18.04 + WIEN2k_17.1 + Intel Parallel Studio XE 2018） ===== | + | ===== コンパイル（Ubuntu18.04 + WIEN2k_19.1 + Intel Parallel Studio XE 2019） ===== |
| 配布されているプログラムをコンパイルします。 | 配布されているプログラムをコンパイルします。 | ||
| [[http:// | [[http:// | ||
| - | * WIEN2k_17.1.tarを入手し、インストールするフォルダに入れる | + | * インストール用のフォルダを作る< |
| + | $ mkdir WIEN2k_19.1 | ||
| + | </ | ||
| + | * WIEN2k_19.1.tarをインストールするフォルダに入れる | ||
| * インストールするフォルダに入って、HPの手順通りに実行するとコードが展開される< | * インストールするフォルダに入って、HPの手順通りに実行するとコードが展開される< | ||
| - | $ tar -xvf WIEN2k_17.1.tar | + | $ tar -xvf WIEN2k_19.1.tar |
| $ gunzip *.gz | $ gunzip *.gz | ||
| $ chmod +x expand_lapw | $ chmod +x expand_lapw | ||
| Line 33: | Line 35: | ||
| </ | </ | ||
| * continue (y/n) y | * continue (y/n) y | ||
| - | * （Intelコンパイラを使う場合）siteconfig を開いて -openmp を -qopenmp に修正する | ||
| - | * （Libxcがインストールされていて、かつver.4以降を使う場合）/ | ||
| - | * [[https:// | ||
| * コンパイルの設定を行う。[Press RETURN to continue][Hit Enter to continue]はEnterを押すだけなので省略< | * コンパイルの設定を行う。[Press RETURN to continue][Hit Enter to continue]はEnterを押すだけなので省略< | ||
| $ ./ | $ ./ | ||
| </ | </ | ||
| - | * もしも Word too long. と表示されて実行できなかったら、siteconfigをvimなどで開いて最初の行を #!/bin/tcsh -f に変更する。 | ||
| - | * https:// | ||
| - | |||
| - Specify a system | - Specify a system | ||
| - [Selection: | - [Selection: | ||
| - | | + | |
| - | - [Your compiler:] ifort | + | - [Your compiler:] ifort |
| - | - [Your compiler: | + | - [Your compiler:] cc (Intelコンパイラは非推奨) |
| - | - [Would you like to use LIBXC (that you have installed)? (y,N):] y | + | - Specify LIBXC settings |
| - | - [Do you want to automatically search for LIBXC installations? | + | |
| - | - [Please specify a comma separated list of directories to search! (If no list is entered, /usr/local and /opt will be searched as default):] /opt/ | + | - Specify FFTW settings |
| - | - [Is this the correct directory? (Y,n):] y | + | - [Do you want to use FFTW (recommended, |
| - | - Compiling Options | + | - [Do you want to automatically search for FFTW installations? |
| - | - [To change an item select option. | + | - [Please specify a comma separated list of directories to search! (If no list is entered, /usr/local and /opt will be searched as default):] /usr/local/ |
| + | - [Please specify whether you want to use FFTW3 (default) or FFTW2 (FFTW3 / FFTW2):] fftw3 | ||
| + | - [Do you want to use a FFTW version from the list above? (Y,n):] y | ||
| + | - [Please enter the line number of the chosen version or enter 0 to manually specify your choice!:] Enter | ||
| + | - [Please specify the target achitecture of your FFTW library | ||
| + | - [Please specify the name of your FFTW library or accept present choice (enter):] Enter | ||
| + | - [Is this correct? (Y,n):] y | ||
| + | - [Selection: | ||
| - Configure Parallel Execution | - Configure Parallel Execution | ||
| - [Shared Memory Architecture? | - [Shared Memory Architecture? | ||
| - | - [(like taskset -c). Enter N / your_specific_command: | + | - [(like taskset -c). Enter N / your_specific_command: |
| - [Do you have MPI, ScaLAPACK, ELPA, or FFTW installed and intend to run finegrained parallel? ... (y/N)] y | - [Do you have MPI, ScaLAPACK, ELPA, or FFTW installed and intend to run finegrained parallel? ... (y/N)] y | ||
| - [Your compiler:] mpiifort | - [Your compiler:] mpiifort | ||
| - | - [Do you want to use a present ScaLAPACK installation? | + | |
| - | - [Do you want to use the MKL version of ScaLAPACK? (Y,n):] y | + | |
| - | - [Do you use Intel MPI? (Y,n):] y | + | - [Do you want to use the MKL version of ScaLAPACK? (Y,n):] y |
| - | - [Is this correct? (Y,n):] y | + | - [Do you use Intel MPI? (Y,n):] y |
| - | - [Do you want to use a present FFTW installation? | + | - [Is this correct? (Y,n):] y |
| - | - [Do you want to automatically search for FFTW installations? | + | - Specify ELPA settings |
| - | - [Please specify whether you want to use FFTW3 (default) or FFTW2 (FFTW3 / FFTW2):] FFTW3 | + | - [Do you want to use ELPA? (y,N):] n |
| - | - [Please specify the path of your FFTW installation (like / | + | |
| - | - [Please specify the target achitecture of your FFTW library (e.g. lib64) or accept present choice (enter):] Enter | + | |
| - | - [Please specify the name of your FFTW library or accept present choice (enter):] Enter | + | - [Please specify your MPIRUN command or accept the recommendations (Enter - default)!:] Enter |
| - | - [Is this correct? (Y,n):] y | + | - [Selection: |
| - | | + | - (Re-)Dimension parameters |
| - | - [Please specify your parallel compiler options or accept the recommendations (Enter - default)!:] Enter | + | |
| - | - [Please specify your MPIRUN command or accept the recommendations (Enter - default)!:] Enter | + | |
| - | - [Selection: | + | |
| - | - Dimension parameters | + | |
| - [Selection: | - [Selection: | ||
| - Compile/ | - Compile/ | ||
| - | - (Ubuntu18.04かつiccを使う場合) ディレクトリ内のSRC_aimのMakefileを開いて、19行目を %%CC = icc -D__PURE_INTEL_C99_HEADERS__%% に変更する。 | ||
| - | - (Ubuntu18.04かつiccを使う場合) ディレクトリ内のSRC_sgropuのMakefileを開いて、20行目を %%FOPT = -D__PURE_INTEL_C99_HEADERS__%% に変更する。 | ||
| - [Selection: | - [Selection: | ||
| - Perl Path | - Perl Path | ||
| Line 101: | Line 98: | ||
| - Specify your program to read pdf files (default is acroread) (on some Linux systems use xpdf): evince | - Specify your program to read pdf files (default is acroread) (on some Linux systems use xpdf): evince | ||
| - Set PDFREADER to evince (Y/n): y | - Set PDFREADER to evince (Y/n): y | ||
| + | - How many cores do you want to use by default (4): (パソコンのコア数を入力。コマンドnprocで調べられる) | ||
| + | - Set OMP_NUM_THREADS to コア数 (Y/n): y | ||
| - Do you want to continue (Y/n)?: y | - Do you want to continue (Y/n)?: y | ||
| - Edit .rhosts file now? (y/N): n | - Edit .rhosts file now? (y/N): n | ||
wien2k/インストール_19.1.txt · Last modified: 2021/06/27 22:04 (external edit)
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