Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- 自作クラスタ計算機:pbs_proの基本設定 [2023/05/02 18:57]
koudai [ノードごとの負荷の分散]
+++ 自作クラスタ計算機:pbs_proの基本設定 [2023/12/26 23:49] (current)
koudai [計算ノードの登録]
@@ Line 126: / Line 126: @@
 $ sudo /etc/init.d/pbs start
 </code>
-  - いったんログアウトして、再ログインします（インストール時に設置された /etc/profile.d/pbs.sh が読み込まれます）。<code>
+  - 環境変数を読み込む設定をします。すべてのユーザーがPBSを使えるように /etc/bash.bashrcを編集します<code>
-$ exit
+$ sudo vim /etc/bash.bashrc
-</code>
+</code><file - bash.bashrc>
+（略）
+. /etc/profile.d/pbs.sh
+</file>
+  - いったんログアウトして、再ログインします
 ===== 計算ノードでの作業 =====
@@ Line 211: / Line 215: @@
 Qmgr: set node keisan12 resources_available.ncpus=24
 ...
+</code>
+ノードの設定状況も確認できます
+<code>
+Qmgr: print node keisan11
+#
+# Create nodes and set their properties.
+#
+#
+# Create and define node yagami11
+#
+create node yagami11
+set node keisan11 state = free
+set node keisan11 resources_available.arch = linux
+set node keisan11 resources_available.host = keisan11
+set node keisan11 resources_available.mem = 131666992kb
+set node keisan11 resources_available.ncpus = 24
+set node keisan11 resources_available.vnode = keisan11
+set node keisan11 resv_enable = True
 </code>
@@ Line 261: / Line 284: @@
 ===== MPIの設置 =====
-  * OpenMPI, MPICH2, Intel MPIなどのMPIライブラリを管理ノードの /usr/local または /opt にインストールし、NFSによって各計算ノードに共有してください
+  * OpenMPI, MPICH2, Intel MPIなどのMPIライブラリを管理ノードの /usr/local や /opt などにインストールし、NFSによって各計算ノードに共有してください
-  * 学生であれば Intel Parallel Studio XE が無償で使えて便利です
 ===== ソースコード =====
@@ Line 375: / Line 396: @@
   * ompthreadsはMPIの1プロセスあたりのOpenMPのスレッド数です
-  * mpiprocs * ompthreads = ncpus となるようにしてください
+  * 基本的には mpiprocs * ompthreads = ncpus となるようにします
-  * OpenMPのスレッド数は、1つの計算ノードに含まれるCPUコア数以下になるようにしてください
 ====== Fairshare ======
@@ Line 399: / Line 419: @@
 node_sort_key: "ncpus HIGH unused"     ALL
 </file>
+（各計算ノードのコア数がすべて同じ場合は、どちらも同じ結果になります）
 PBSを再起動します。

雑多な記録

User Tools

Site Tools

Differences

Page Tools