http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/ 2026-05-13T08:48:55+00:00 http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/ http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/lib/exe/fetch.php?media=wiki:dokuwiki.svg text/html 2021-07-09T16:16:03+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=alamode&rev=1625847363&do=diff 概要 * ALAMODEはフォノンの計算を行うソフトウェアです * フォノンの調和項、および非調和項を計算することができます * 使用にはVASP, QuantumESPRESSO, xTAPP, OpenMXのいずれかのパッケージが必要です。このページではQEを使用します。 text/html 2021-06-27T13:04:16+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=dokuwiki&rev=1624799056&do=diff 概要 このwikiの設置の記録です。 目次 * インストール * プラグイン * 更新 text/html 2021-06-27T13:04:16+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=inkscape&rev=1624799056&do=diff エクステンション * textext text/html 2021-06-27T13:04:16+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=intel_software&rev=1624799056&do=diff * oneAPI 廃止 * Parallel_Studio_XE * Performance_Libraries * オープンソースの Intel oneAPI Base & HPC Toolkit に生まれ変わりました。 text/html 2022-08-13T11:42:40+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=julia&rev=1660390960&do=diff 概要 Juliaの勉強した記録 使用環境 * Ubuntu 20.04 LTS * Julia 1.6 準備 * 設置方法 勉強方法 * <https://docs.julialang.org/en/v1/> * 公式ドキュメントで、これのManualを一通りやれば最低限必要な知識が身につきます。 * <https://inzkyk.xyz/julia_doc/welcome/> * 上のドキュメントを日本語訳しているページです text/html 2024-03-13T05:48:05+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=latex&rev=1710308885&do=diff TeX Live * インストール * パッケージの追加 * 物理分野のおすすめのパッケージ latexmk * latexmkの設定 TeXworks * TeXworksのインストール VScode * VScodeによるLaTeX環境の基本設定 text/html 2024-10-03T08:34:06+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=python&rev=1727944446&do=diff ディストリビューション * Anaconda ライブラリ * matplotlib * Qiskit * QuSpin text/html 2024-02-04T13:52:34+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=quantumespresso&rev=1707054754&do=diff 第一原理計算ソフトQuantumESPRESSOの使い方をまとめました。 導入編 * インストール方法_7.3 * 擬ポテンシャルの入手 過去の分 * インストール方法_6.7 * インストール方法 入門編 まずはこれを読んで基本的な操作方法を習得してください * 半導体 * 金属 * 磁性体 * 並列計算 * 収束判定 * よくあるエラー * text/html 2021-06-27T13:18:50+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=sidebar&rev=1624799930&do=diff 雑多な記録 index text/html 2024-10-21T08:26:52+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=start&rev=1729499212&do=diff このWikiについて 研究活動で記録したものの中から、役に立ちそうなものを公開しています。 管理者について このWikiの管理者のHPは以下です。 * <http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/> 間違いなどありましたらメールなどでご指摘をいただけると幸いです。 text/html 2021-06-27T13:04:16+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=torque&rev=1624799056&do=diff Torqueはジョブ管理システムです。 数値計算などで複数のプログラムを同時に走らせたいときに重宝します。 * インストール 工事中 * ぼっちTorque 普通は複数台のサーバーをつなげてジョブを管理しますが、ここでは1台のパソコンでジョブ管理する方法をまとめました。 text/html 2026-05-10T09:36:04+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=ubuntu&rev=1778405764&do=diff 概要 * Ubuntuにほどこした設定を備忘録的にまとめました 目次 * 日本語入力 * ストレージのフォーマット * ネットワーク帯域幅の測定 text/html 2021-06-27T13:04:16+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=vesta&rev=1624799056&do=diff 概要 * 結晶構造を可視化したり、CIFファイルを作ったりできます。 * Ubuntu 18.04, VESTA 3.4.4 で動作確認しています。 導入方法（Ubuntu） 公式サイトでソフトをダウンロードします。 OSが32bit版のときは VESTA-i686.tar.bz2 を、64bit版のときは VESTA-x86_64.tar.bz2 をダウンロードしてください。 （以下では64bit版で説明） text/html 2023-04-23T08:00:33+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=wien2k&rev=1682236833&do=diff 全電子法による第一原理計算パッケージWIEN2kの使い方を解説します。 w2webというブラウザ上で実行できるソフトも付属しますが、ここでは大量の計算を行うときに便利なコマンドラインから実行する方法を解説します。 text/html 2021-06-27T13:04:17+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=windows_subsystem_for_linux&rev=1624799057&do=diff 概要 * Windows上でネイティブにLinuxが使えるWindows Subsystem for Linux (WSL)の簡単な使い方の解説です。 * Ubuntu 18.04を使用しています。 目次 WSL2 Windows 10 ver.2004（2020年5月配布予定）以降で使えます。 割と実用的になりました。 Windows Insider Program に登録すればこのアップデートを待たずに使用できます。 text/html 2021-06-27T13:04:17+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=xcrysden&rev=1624799057&do=diff 概要 QuantumESPRESSOやWIEN2kの入力（あるいは出力）ファイルから、結晶構造を3次元的に表示するソフトです。 環境 Ubuntu 16.04 インストール方法 aptによる入手 Ubuntuならaptで入手できます。 text/html 2022-06-21T23:42:20+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=%E5%87%BA%E5%BC%B5&rev=1655854940&do=diff 出張の際のいろいろなチェックリスト * 航空券やホテルの手配 * 持ち物 text/html 2022-01-05T16:11:41+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=%E5%A5%91%E7%B4%84%E9%96%A2%E4%BF%82%E3%81%AE%E9%9B%91%E5%A4%9A%E3%81%AA%E8%A8%98%E9%8C%B2&rev=1641399101&do=diff 概要 一般人は人生で数回しかやらないのにやたら熟知していることが求められる契約関係についてのメモです。 いずれも超個人的な見解です。 目次 * 引っ越し * 水回りの修繕 text/html 2023-07-20T15:35:51+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=%E6%95%B0%E5%80%A4%E8%A8%88%E7%AE%97%E3%83%A9%E3%82%A4%E3%83%96%E3%83%A9%E3%83%AA&rev=1689867351&do=diff コンパイラ・汎用ライブラリ * GCC * GSL * OpenMPI * FFTW3 * FFTW2 * Libxc * Spglib * Boost 固体物理・強相関系 * ITensor * TRIQS 量子計算 * Qiskit text/html 2026-05-08T07:30:09+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=%E8%87%AA%E4%BD%9C%E3%82%AF%E3%83%A9%E3%82%B9%E3%82%BF%E8%A8%88%E7%AE%97%E6%A9%9F&rev=1778225409&do=diff 概要 * 研究室に入ってきた四年生が一人でクラスタ計算機を作れることを目指して、このページを作成しました * OSは Ubuntu 18.04, 20.04 のServer版を使用して、初心者でもスムーズに進められるようにaptを多用しています。 text/html 2021-06-27T13:04:16+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://www2.yukawa.kyoto-u.ac.jp/~koudai.sugimoto/dokuwiki/doku.php?id=%E8%8B%B1%E8%AA%9E&rev=1624799056&do=diff 発音を間違えやすい単語