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--- xcrysden [2018/06/01 21:24] – 作成 koudai
+++ xcrysden [2026/06/09 04:01] (current) – [トラブルシューティング] koudai
@@ Line 10: / Line 10: @@
 ====== インストール方法 ======
-===== aptから =====
+===== aptによる入手 =====
 Ubuntuならaptで入手できます。
@@ Line 18: / Line 18: @@
 この場合、/usr/share/xcrysden/にインストールされます。
-===== ソースコードから =====
+===== ソースコードから自分でコンパイル =====
 ==== 事前に必要なもの ====
@@ Line 31: / Line 31: @@
 $ sudo apt install fftw3
 $ sudo apt install fftw3-dev
+</code>
 ==== ソースコードの入手 ====
@@ Line 71: / Line 71: @@
 $ ./xcConfigure.sh
 </code>
-質問に答えていきます。 自動的にbashrcを書き換えてくれるので、設定が終わったらコンピュータを再起動するか
+質問に答えていきます。
+自動的にbashrcを書き換えてくれるので、終わったら
 <code>
 $ source ~/.bashrc
@@ Line 77: / Line 78: @@
 で設定が反映されます。
-==== 使用方法 ====
+====== 使用方法 ======
 ターミナルから
@@ Line 85: / Line 86: @@
 で起動できます。
+====== トラブルシューティング ======
+Ubuntu 24.04, 26.04では、以下のメッセージとともに起動しなくなるバグが報告されています
+<code>
+$ xcrysden
++-----------------------------------------------------------------+
+|*****************************************************************|
+|*                                                               *|
+|*  XCrySDen -- (X-Window) CRYstalline Structures and DENsities  *|
+|*               =         ===         =              ===        *|
+|*---------------------------------------------------------------*|
+|*                                                               *|
+|*    Anton Kokalj (tone.kokalj@ijs.si)                          *|
+|*    Jozef Stefan Institute, Ljubljana, Slovenia                *|
+|*                                                               *|
+|*    Copyright (c) 1996--2019 by Anton Kokalj                   *|
+|*                                                               *|
+|*****************************************************************|
++-----------------------------------------------------------------+
+  Version: 1.6.2
+  Please report bugs to: tone.kokalj@ijs.si
+  TERMS OF USE:
+  -------------
+  XCRYSDEN is released under the GNU General Public License.
+  Whenever graphics generated by XCRYSDEN are used in scientific
+  publications, it shall be greatly appreciated to include an explicit
+  reference. The preferred form is the following:
+  [ref] A. Kokalj, J. Mol. Graph. Model., Vol. 17, pp. 176-179, 1999.
+        Code available from http://www.xcrysden.org/.
+XCRYSDEN_TOPDIR=/usr/share/xcrysden
+XCRYSDEN_SCRATCH=/tmp
+Running on platform : unix
+   Operating system : Linux
+Package ImageMagick's convert: /usr/bin/convert
+Package ImageMagick's import: /usr/bin/import
+Package Ppmtompeg: /usr/bin/ppmtompeg
+Executing: /usr/lib/xcrysden/ftnunit
+Error in startup script:
+Couldn't configure togl widget
+    while executing
+"togl .mesa  -width          400  -height         400  -ident          .mesa  -rgba           $toglOpt(rgba)           -redsize        $toglOpt(redsize..."
+    (procedure "PlaceGlobWin" line 107)
+    invoked from within
+"PlaceGlobWin 0 [expr round(670 * $fac1)] [expr round(670 * $fac1)]"
+    (procedure "ViewMol" line 25)
+    invoked from within
+"ViewMol ."
+    invoked from within
+"if { [llength $argv] > 2 } {
+    parseComLinArg [lrange $argv 2 end]
+} else {
+    ViewMol .
+}"
+    (file "/usr/share/xcrysden/Tcl/xcInit.tcl" line 633)
+</code>
+この場合は、
+<code>
+$ cd
+$ mkdir .xcrysden
+$ cd .xcrysden
+$ cp /usr/share/xcrysden/Tcl/custom-definitions .
+$ vim custom-definitions
+</code>
+<file>
+（略）
+set toglOpt(accum) false
+#set toglOpt(stereo) none
+（略）
+</file>
+としてください。
+/usr/share/は、手動でインストールした場合は、そのインストールしたディレクトリです。
+===== 参考 =====
+  * https://mailman.ijs.si/pipermail/xcrysden/2025-March/002167.html