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xcrysden

概要

QuantumESPRESSOやWIEN2kの入力(あるいは出力)ファイルから、結晶構造を3次元的に表示するソフトです。

環境

Ubuntu 16.04

インストール方法

aptによる入手

Ubuntuならaptで入手できます。

$ sudo apt install xcrysden

この場合、/usr/share/xcrysden/にインストールされます。

ソースコードから自分でコンパイル

事前に必要なもの

Xorg, OpenGL, FFTW3が必要です。 入れてない分に関してインストールしてください。

$ sudo apt install xorg-dev
$ sudo apt install xorg-docs
$ sudo apt install xutils-dev # いらないかも・・・
$ sudo apt install libgl1-mesa-dev
$ sudo apt install libglu1-mesa-dev
$ sudo apt install fftw3
$ sudo apt install fftw3-dev

ソースコードの入手

xcrysden-1.5.60.tar.gzをダウンロードします。 最新バージョンは1.5.60です。

コンパイル

ダウンロードしてきたファイルを解凍し。そのディレクトリに入ります。

$ tar xzvf xcrysden-1.5.60
$ cd xcrysden-1.5.60

インストールの設定をするため、systemディレクトリからMake.sys-semisharedをコピーしてきて、Make.sysというファイル名にします。 なにをしているかわかる場合は、他のファイルをもってきて編集してもよいです。

$ cp system/Make.sys-semishared Make.sys

Make.sysでコンパイラはデフォルトでgccとgfortranになっていますが、Intelコンパイラを使いたい場合は次のように変更します。

Make.sys
(略)
CC = icc
(略)
FC = ifort
(略)

これで準備ができたので、ソースコードをmakeします。

$ make all

環境設定

次にコンピュータの環境設定をします。

$ cd scripts
$ ./xcConfigure.sh

質問に答えていきます。 自動的にbashrcを書き換えてくれるので、終わったら

$ source ~/.bashrc

で設定が反映されます。

使用方法

ターミナルから

$ xcrysden

で起動できます。

xcrysden.txt · Last modified: 2021/06/27 22:04 by 127.0.0.1