数値計算ライブラリ:fftw3
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概要
高速フーリエ変換をおこなうライブラリFFTWのインストール方法です。
環境
- Ubuntu 22.04
ソースコードの入手
インストール
入手したfftw-3.3.10.tar.gzをホーム・ディレクトリに置き、ターミナルで以下のように入力します。 以下は並列計算に対応したFFTWを使うときの例です。
$ tar -zxvf fftw-3.3.10.tar.gz $ cd fftw-3.3.10 $ ./configure --prefix=/usr/local/fftw3 CC=icx MPICC=mpiicc F77=ifort --enable-mpi --enable-threads # Intelコンパイラの場合 $ ./configure --prefix=/usr/local/fftw3 CC=gcc MPICC=mpicc F77=gfortran --enable-mpi --enable-threads # GNUコンパイラの場合 $ make $ sudo make install
以上で完成です。 ライブラリは /usr/local/fftw3/lib/ に、インクルードファイルは /usr/local/fftw3/include/ に設置されます。
configureのいろいろ
configureはデフォルトでいろいろ設定してくれますが、オプションをつけることで自分でも設定できます。 オプションは次のようにして確認できます。
$ ./configure --help
- --enable-threads … メモリ共有型の並列計算を行いたいときに追加します
- --enable-openmp … メモリ共有型の並列計算でOpenMPを使用したいときに追加します(通常は--enable-threadsのみで十分です)
古い情報
- Ubuntu 18.04
入手したfftw-3.3.9.tar.gzをホーム・ディレクトリに置き、ターミナルで以下のように入力します。 以下は並列計算に対応したFFTWを使うときの例です。
$ tar -zxvf fftw-3.3.9.tar.gz $ cd fftw-3.3.9 $ ./configure --prefix=/usr/local/fftw3 CC=icpc MPICC=mpiicc F77=ifort --enable-mpi --enable-threads # Intelコンパイラの場合 $ ./configure --prefix=/usr/local/fftw3 CC=gcc MPICC=mpicc F77=gfortran --enable-mpi --enable-threads # GNUコンパイラの場合 $ make $ sudo make install
以上で完成です。 ライブラリは /usr/local/fftw3/lib/ に、インクルードファイルは /usr/local/fftw3/include/ に設置されます。
configureのいろいろ
configureはデフォルトでいろいろ設定してくれますが、オプションをつけることで自分でも設定できます。 オプションは次のようにして確認できます。
$ ./configure --help
- --enable-threads … メモリ共有型の並列計算を行いたいときに追加します
- --enable-openmp … メモリ共有型の並列計算でOpenMPを使用したいときに追加します(通常は--enable-threadsのみで十分です)
もっと古い情報
- Ubuntu 18.04
入手したfftw-3.3.8.tar.gzをホーム・ディレクトリに置き、ターミナルで以下のように入力します。 以下はMPIを使うときの例です。
$ tar -zxvf fftw-3.3.8.tar.gz $ cd fftw-3.3.8 $ ./configure --prefix=/usr/local/fftw3 CC=icpc MPICC=mpiicc F77=ifort --enable-mpi --enable-threads CFLAGS="-D__PURE_INTEL_C99_HEADERS__" # Intelコンパイラの場合 $ ./configure --prefix=/usr/local/fftw3 CC=gcc MPICC=mpiicc F77=ifort --enable-mpi --enable-threads # Intelコンパイラでエラーが出る場合 $ ./configure --prefix=/usr/local/fftw3 CC=gcc MPICC=mpicc F77=gfortran --enable-mpi --enable-threads # GNUコンパイラの場合 $ make $ sudo make install
以上で完成です。
- (Ubuntu 18.04 & Intel XE2019) icpcでコンパイルするとエラーが出るようになったので CC=gcc としてください)
ライブラリは /usr/local/fftw3/lib/ に、インクルードファイルは /usr/local/fftw3/include/ に設置されます。
数値計算ライブラリ/fftw3.txt · Last modified: 2023/04/23 16:58 by koudai