概要

研究室に入ってきた四年生が一人でクラスタ計算機を作れることを目指して、このページを作成しました
OSはUbuntuを使用して、初心者でもスムーズに進められるようにaptを多用しています。
- 現在の確認環境：
  - フロントエンド：Ubuntu Desktop 26.04 LTS
  - 計算ノート：Ubuntu Server 26.04 LTS

ハードウェア

事前に管理ノードおよび計算ノードにUbuntuをインストールしてください。

管理者のユーザー名は実際に数値計算で利用するときのユーザーと違うものにして、system_adminなどの当たり障りのないのない名前にしておくことを推奨します。（ただし、単にadminにしてしまうとLDAPの管理者名とかぶるので不向きです）

管理ノードと計算ノードからなるプライベートネットワークを構築します。作業は管理ノード、あるいは計算ノードを直接操作して行います。

管理ノードと計算ノードを一元管理し、あたかも1つのコンピュータとして扱えるようにします。 SSHで外部からアクセスできるようにした場合、作業は遠隔で行うことができます。

PXEブートを使えば、管理ノードに計算ノード用のOSを入れ、計算ノードはそれを読み込んで起動できるようになります。計算ノードにHDDやSSDといった記憶用ディスクを設置する必要がなくなり、計算ノードの故障率の低下や、計算ノードの個別管理が不要といったメリットがあります。

事前に管理ノードにのみOSをインストールしてください

開発環境
- aptで導入可能な、各ノードにインストールしておくと便利なパッケージです。自分の目的に合わせて適当に導入してください
MPIによる並列計算
- 実際にクラスタ計算機でノード内およびノード間での並列計算を行います
- ジョブ管理ソフトを使って計算ノードにジョブを投入する予定の場合は、このページを読む必要はありません

複数人でクラスタ計算機を利用するときに、各ユーザーのプログラムが計算ノードで実行される順番を管理します。一人で複数のプログラムを実行する際にも便利です。代表的なものにPBSとSLURMがあります。