数値計算ライブラリ:gcc
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概要
- GCCは Gnu Compiler Collection の略で、基本的なプログラミング言語のコンパイラを提供します
インストール
検証環境
- Ubuntu 18.04 LTS
準備
事前にmakeのインストールが必要です。 入っていない場合は以下のようにして入手します。
$ sudo apt install make build-essential gfortran
入手
インストール
ダウンロードしたファイルはホーム・ディレクトリにおいてください。 これを展開します。
$ tar xzvf openmpi-4.0.2.tar.gz $ cd openmpi-4.0.2
インストール前に、インストール先とコンパイラを指定します。
$ ./configure --prefix=/usr/local/openmpi CC=gcc CXX=g++ FC=gfortran
管理者権限を持っていない場合は prefix=/home/username/openmpi などとすればよいでしょう。 そしてコンパイルします。
$ make all $ sudo make install
環境設定
~/.bashrcを開いて、ファイルの最後に次の文を付け加えます。
MPIROOT=/usr/local/openmpi PATH=$MPIROOT/bin:$PATH LD_LIBRARY_PATH=$MPIROOT/lib:$LD_LIBRARY_PATH MANPATH=$MPIROOT/share/man:$MANPATH export MPIROOT PATH LD_LIBRARY_PATH MANPATH
編集が終わったら
$ source ~/.bashrc
で再度読み込みます。
$ mpif90 -v $ mpicc -v
などで、インストールが成功したか確認できます。
コンパイルと実行
コンパイルは、
- Fortranの場合
$ mpif90 -o test test.f90
- C++の場合
$ mpicc -o test test.cc
でできます。 コンパイルオプションの付け方はgfortranやgcc, g++のときと同じです。 MPIで実行する場合は
$ mpirun -n 2 test
ここで-nで指定してるのはプロセスの数(並列数)です。
注意
- OpenMPIの並列数は、最大でも物理コア数までにします。
- IntelのCPUだとハイパースレッディングにより論理コアが物理コアの2倍に見えますが、並列数を論理コア数にして計算すると実行速度が著しく低下することがあります。
- 最近のOpenMPIは並列数を物理コア数よりも大きくするとエラーが出るようになりました。
参考資料
参考
数値計算ライブラリ/gcc.1583728653.txt.gz · Last modified: 2021/06/27 21:57 (external edit)