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OSはUbuntu14.04を使いました。
必要なソフトウェア
事前にOpenMPIあるいはMPICHのインストールが必要です。 (一応、設定ではserial計算も可能です。)
QuantumESPRESSOのインストール
Quantum ESPRESSOのパッケージはhttp://www.quantum-espresso.org/からダウンロードできます。 ページ上部メニューから[DOWNLOAD]を選び、横のメニューバーにある [Download page] からダウンロードできます。 ダンロードしたファイルはホーム・ディレクトリに保存します。 Linuxのターミナル(端末)を開き、次のように入力してダウンロードしたファイルを解凍し、解凍したディレクトリの中に入ります。
$ tar -xzvf qe-6.2.1.tar.gz $ cd qe-6.2.1
あるいは最新版であれば GitHub https://github.com/QEF/q-e/ からも入手できます
$ sudo apt install git $ git clone https://github.com/QEF/q-e.git $ cd q-e
Quantum ESPRESSOのインストールに必要な設定をします。
$ ./configure F90=gfortran F77=gfortran CC=gcc MPIF90=mpif90 --enable-openmp --enable-parallel $ GNUコンパイラ $ ./configure MPIF90=mpiifort F90=ifort F77=ifort CC=gcc --enable-openmp --enable-parallel --with-scalapack=intel # Intelコンパイラ $ ./configure MPIF90=mpiifort F90=ifort F77=ifort CC=icc CFLAGS="-D__PURE_INTEL_C99_HEADERS__" --enable-openmp --enable-parallel --with-scalapack=intel # iccがどうしても使いたい場合 $ make all
GNUコンパイラを使う場合でも、MKLが入っていれば自動でMKLを使用します。
makeには時間がかかるので、のんびり終わるのを待ちます。 コンパイルが終了したら、ホーム・ディレクトリにある.bashrc を編集します。
$ gedit ~/.bashrc
でファイルを開き、ファイルの一番最後の行に次の一文を書き加えます。
export PATH=$PATH:/home/username/qe-6.2.1/bin/
ファイルを保存、終了して端末に戻り、 .bashrc を読み込んでインストールが完了します。
$ source ~/.bashrc
あるいはコンピュータを再起動することでもインストールが完了します。
Intel MKLを使う場合の注意
Intel MKL 11.3.2および11.3.3のScaLAPACKにバグがあり、MPIによる並列計算を実行したときにエラーが出力されることがあります。 MKLを使う場合は、それ以前あるいはそれ以後のバージョンを使用するように注意してください。
XCrySDenのインストール
XCrySDenは結晶構造やフェルミ面、電荷密度分布といったものを3Dで表示するソフトです。 入れておくと大変便利です。
UbuntuなどのDebian系でapt-getが使えれば、インストールは極めて簡単です。 端末を開いて
$ sudo apt-get install xcrysden
でインストールが完了します。
メモ
Ubuntu 16.04でmake allしたら次のエラーメッセージが出てきました(QE6.0)。
$ ./configure F90=ifort F77=ifort CC=icc MPIF90=mpiifort (いろいろ出てくる) configure: success $ make all test -d bin || mkdir bin ( cd FFTXlib ; make TLDEPS= all || exit 1 ) make[1]: ディレクトリ '/home/username/qe-6.0/FFTXlib' に入ります mpif90 -O3 -g -x f95-cpp-input -D__GFORTRAN -D__STD_F95 -D__DFTI -I/home>/username/qe-6.0//include -I../include/ -I/opt/intel/compilers_and_libraries_2016.1.150/linux/mkl/include -c fft_support.f90 ifort: コマンドライン警告 #10155: オプション '-x' を無視します。引数が必要です。 ifort: エラー #10236: ファイルが見つかりません: 'f95-cpp-input' (以下略)
configureファイルがうまく生成されていないようです。 こうなった場合は
$ ./configure F90=ifort F77=ifort CC=gcc MPIF90=mpif90
とすればうまく行きました。