wien2k:インストール_19.1
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Table of Contents
準備
以下のソフトを事前にインストールしてください。
- tcsh
- XCrySDen
- MPIでコンパイルしたFFTW3
- --enable-openmp のフラグをつけてコンパイルした場合はうまく行きませんでした
- C/C++とFortranのコンパイラ。Intel Parallel Studio XE 推奨
tcshなどはaptで手に入ります。
$ sudo apt install tcsh
手順
有料ソフトなので、当然ですが事前に購入する必要があります。
商用だと50万円くらいしますが、アカデミック版は5万円くらいで買えます。
コンパイル(Ubuntu18.04 + WIEN2k_19.1 + Intel Parallel Studio XE 2019)
配布されているプログラムをコンパイルします。 WIEN2k-Registered Users
- インストール用のフォルダを作る
$ mkdir WIEN2k_19.1
- WIEN2k_19.1.tarをインストールするフォルダに入れる
- インストールするフォルダに入って、HPの手順通りに実行するとコードが展開される
$ tar -xvf WIEN2k_19.1.tar $ gunzip *.gz $ chmod +x expand_lapw $ ./expand_lapw
- continue (y/n) y
- コンパイルの設定を行う。[Press RETURN to continue][Hit Enter to continue]はEnterを押すだけなので省略
$ ./siteconfig
- Specify a system
- [Selection:] LI
- Specify compiler and linker options
- [Your compiler:] ifort
- [Your compiler:] cc (Intelコンパイラは非推奨)
- Specify LIBXC settings
- [Would you like to use LIBXC (that you have installed)? (y,N):] n
- Specify FFTW settings
- [Do you want to use FFTW (recommended, but for sequential code not required)? (Y,n):] y
- [Do you want to automatically search for FFTW installations? (Y,n):] y
- [Please specify a comma separated list of directories to search! (If no list is entered, /usr/local and /opt will be searched as default):] /usr/local/
- [Please specify whether you want to use FFTW3 (default) or FFTW2 (FFTW3 / FFTW2):] fftw3
- [Do you want to use a FFTW version from the list above? (Y,n):] y
- [Please enter the line number of the chosen version or enter 0 to manually specify your choice!:] Enter
- [Please specify the target achitecture of your FFTW library (e.g. lib64) or accept present choice (enter):] lib
- [Please specify the name of your FFTW library or accept present choice (enter):] Enter
- [Is this correct? (Y,n):] y
- [Selection:] s
- Configure Parallel Execution
- [Shared Memory Architecture? (y/N):] y
- [(like taskset -c). Enter N / your_specific_command:] n
- [Do you have MPI, ScaLAPACK, ELPA, or FFTW installed and intend to run finegrained parallel? … (y/N)] y
- [Your compiler:] mpiifort
- Specify ScaLAPACK settings
- [Do you want to use a present ScaLAPACK installation? (Y,n):] y
- [Do you want to use the MKL version of ScaLAPACK? (Y,n):] y
- [Do you use Intel MPI? (Y,n):] y
- [Is this correct? (Y,n):] y
- Specify ELPA settings
- [Do you want to use ELPA? (y,N):] n
- Configure parallel execution
- [Please specify your parallel compiler options or accept the recommendations (Enter - default)!:] Enter
- [Please specify your MPIRUN command or accept the recommendations (Enter - default)!:] Enter
- [Selection:] S
- (Re-)Dimension parameters
- [Selection:] Q
- Compile/Recompile programs
- [Selection:] A
- Perl Path
- [Please enter the full path of the perl program:] /usr/bin/perl
- Temp Path
- [Please enter the full path to your temporary directory:] /tmp
補足
Intel OneAPI (2021) を使うとFFTW3とのリンクでエラーが出るので、コンパイラオプションに -lstdc++ を追加してください。
参考
ユーザーごとの設定
$ cd /path/to/WIEN2k/ $ ./userconfig_lapw
- editor shall be: vim
- Set editor to vim (Y/n): y
- DATA directory: /home/username/WIEN2kdata
- Set DATA directory to /home/username/WIEN2kdata (Y/n): y
- scratch directory: Enter
- Set scratch directory to working directory: y
- Specify your program to read pdf files (default is acroread) (on some Linux systems use xpdf): evince
- Set PDFREADER to evince (Y/n): y
- How many cores do you want to use by default (4): (パソコンのコア数を入力。コマンドnprocで調べられる)
- Set OMP_NUM_THREADS to コア数 (Y/n): y
- Do you want to continue (Y/n)?: y
- Edit .rhosts file now? (y/N): n
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